Xenosaga Episode III: Also sprach Zarathustra

Третья, и, по словам разработчиков, заключительная, часть Xenosaga, озаглавленная как ~Also Sprach Zarathustra~, вышла летом 2006 года, и, как это ни странно, является прямым продолжением событий предыдущего эпизода.

Действие игры происходит спустя год после событий второй части. «Главный» персонаж всё тот же — ведущий сотрудник корпорации Vector Industries, Шион Узуки (Shion Uzuki). Ну, теперь уже бывший ведущий сотрудник — Шион уволилась из корпорации, так как начала подозревать управляющий состав Вектора в явлении, получившем название Терроризм Гнозис (Gnosis Terrorism), и узнала то, что её отец, Суоу Узуки (Suou Uzuki), работал на противоборствующую сторону, организацию U-TIC. Теперь Шион действует в сотрудничестве с повстанческой группировкой Scientia в надежде найти либо подтверждения, либо опровержения своим умозаключениям.